可能会。
根据国家质量监督检验检疫局发布的《车辆驾驶人员血液、呼气酒精含量阈值与检验》（GB19522—2004）中规定，该规定指出，饮酒驾车是指车辆驾驶人员血液中的酒精含量大于或者等于20mg/100ml，小于80mg/100ml的驾驶行为。
而藿香正气水中含有40％—50％的酒精含量，患者喝了之后，这些酒精会立马进入体内，如此时马上开车遭遇检验酒驾的话，很可能会查处酒驾行为。
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